Τα πλοία από Αγαθονήσι προς Ρόδο λειτουργούνε κανονικά2 φορές την εβδομάδα. Η συχνότητα των δρομολογίων μπορεί να αυξηθεί στις περιόδους αιχμής κατά τη διάρκεια του καλοκαιριού και να μειωθεί κατά τη χειμερινή περίοδο.

Τα ταξίδια με πλοίο ��πό Αγαθονήσι προς Ρόδο παίρνουν κατά μέσο όρο συνήθως 4 h 40 m. Το πρώτο πλοίο συνήθως φεύγει από Αγαθονήσι στις 08:40 και φθάνει προς Ρόδο στις17:20.