Τα πλοία από Μήλο προς Κουφονήσι φθάνουν στην ακμή τους σε πάνω από 2 ημερήσια δρομολόγια. Η συχνότητα πλεύσης συνήθως φθάνει στην ακμή της τους καλοκαιρινούς μήνες, με περίπου 7 αναχωρήσεις που προσφέρονται κάθε εβδομάδα. Ενώ τα προγράμματα μπορεί να μειωθούν α��ό Μήλο προς Κουφονήσι τις άλλες εποχές, οι ακτοπλοϊκές υπηρεσίες είναι ακόμα διαθέσιμες.

Τα ταξίδια με πλοίο από Μήλο προς Κουφονήσι παίρνουν κατά μέσο όρο συνήθως 4 h 30 m. Το πρώτο πλοίο συνήθως φεύγει από Μήλο στις 08:00, και φτάνει προς Κουφονήσι στις 12:30 Το τελευταίο πλοίο συνήθως φεύγει στις12:25 και φθάνει στις 17:15.