I traghetti da Iraklio a Rodi possono arrivare al massimo a 3 partenze giornaliere. La frequenza di navigazione di solito è massima nei mesi estivi, con circa 8 partenze a settimana. Sebbene potrebbero operare con orari ridotti in altre stagioni, spesso i servizi di traghetti da Iraklio a Rodi sono comunque disponibili.

Normalmente il viaggio in traghetto da Iraklio a Rodi dura in media 27 h 55 m. Di solito, il primo traghetto della giornata parte da Iraklio alle 04:00 e arriva a Rodi alle 04:25 L'ultimo traghetto della giornata parte alle 23:45 e arriva alle 17:00.