I traghetti da Patmo a Lisso possono arrivare al massimo a 2 partenze giornaliere. La frequenza di navigazione di solito è massima nei mesi estivi, con circa 8 partenze a settimana. Sebbene potrebbero operare con orari ridotti in altre stagioni, spesso i servizi di traghetti da Patmo a Lisso sono comunque disponibili.

Normalmente il viaggio in traghetto da Patmo a Lisso dura in media 1 h 25 m. Di solito, il primo traghetto della giornata parte da Patmo alle 09:40 e arriva a Lisso alle 00:35 L'ultimo traghetto della giornata parte alle 22:40 e arriva alle 23:10.